В чем же отличия?
Настройка это когда проводят настройку именно в самой системе, когда “нажимают в нужные пункты меню” в самой системе.

Правильнее использовать термин внедрение.
Т.к. внедрение это когда прописыватся подробное ТЗ (важно его подписать, чтобы подстраховать себя на выполнение всех обязательств интегратора), после этого уже делается настройка (когда нужно знать “куда кликать” по тз), после этого сдача проекта вам как клиенту, когда показывается рабочая система и обучение как работать в системе. Это может быть как просто записанные ролики, как и онлайн обучение или личная встреча.
У нас 80% клиентам достаточно подробное видео обучение, которое у них остается. Также при необходимости проводим онлайн обучение.

Терминология на самом деле важна, т.к. это показывает образованность интегратора